最明显的症状就是枝条萎焉。
瓜蔓感病，近节部呈淡黄色油渍状、椭圆至不整齐病斑，病斑略显凹陷，斑上密生小黑点，要是严重其表皮破裂，出现黄白色胶状物，干枯后变成红褐色或黑色块状。果实染病初期为水渍状，后星状开裂，发黑腐烂。
甜瓜蔓枯病茎蔓感病，多在茎节处形成水渍状的病斑，随着病情发展逐渐变为灰白，甚至变成浅红褐色坏死斑，然后有红色胶状物溢出，发病后期茎秆腐烂，直至死秧。
